补发工资计算个人所得税的话，目前的普遍做法是允许还原至所属月份计算缴纳个人所得税，计算公式为：所属月份补发工资应纳税额={[（所属月份补发工资+原所属月份的工资薪金所得）—费用减除额]×适用税率-速算扣除数}—原所属月份已缴纳的个人所得税。
【法律依据】
《个人所得税法》第九条规定，个人所得税以所得人为纳税人，以支付所得的单位或者个人为扣缴义务人。纳税人有中国公民身份号码的，以中国公民身份号码为纳税人识别号；纳税人没有中国公民身份号码的，由税务机关赋予其纳税人识别号。扣缴义务人扣缴税款时，纳税人应当向扣缴义务人提供纳税人识别号。
1、如题所述，目前的普遍做法是允许还原至所属月份计算缴纳个人所得税，计算公式为：所属月份补发工资应纳税额={[（所属月份补发工资+原所属月份的工资薪金所得）-费用减除额]×适用税率-速算扣除数}-原所属月份已缴纳的个人所得税；
2、按照个税法规定，工资薪金所得按月计算，应以纳税人一个月内取得的所有工资薪金所得一并计算缴纳个人所得税。在企业单位实际工作中，确实存在因政策原因、或因资金周转困难等原因导致不能按时发放工资而采取集中补发工资的情形。
若按税法规定计算缴纳个人所得税，纳税人的税负明显畸高。各地税务机关特此而发文允许还原至所属月份计算缴纳个人所得税的做法；
3、例如：粤地税发[1999]239号文件《广东省地方税务局关于对补发以往月份工资计算个人所得税问题的通知》、大地税个[1997] 101号文件《大连市地方税务局关于明确调整个人所得税若干政策问题的通知》均对此作了明确；
4、可见，应予结合当地税收相关文件规定予以核实为妥。
扩展资料：
一、个人所得税根据不同的征税项目，分别规定了三种不同的税率：
1、综合所得（工资、薪金所得，劳务报酬所得，稿酬所得，特许权使用费所得），适用7级超额累进税率，按月应纳税所得额计算征税。该税率按个人月工资、薪金应税所得额划分级距，最高一级为45%，最低一级为3%，共7级。
2、经营所得适用5级超额累进税率。适用按年计算、分月预缴税款的个体工商户的生产、经营所得和对企事业单位的承包经营、承租经营的全年应纳税所得额划分级距，最低一级为5%，最高一级为35%，共5级。
3、比例税率。对个人的利息、股息、红利所得，财产租赁所得，财产转让所得，偶然所得和其他所得，按次计算征收个人所得税，适用20%的比例税率。
二、工资、薪金所得
工资、薪金所得，是指个人因任职或受雇而取得的工资、薪金、奖金、年终加薪、劳动分红、津贴、补贴以及与任职或受雇有关的其他所得。
这就是说，个人取得的所得，只要是与任职、受雇有关，不管其单位的资金开支渠道或以现金、实物、有价证券等形式支付的，都是工资、薪金所得项目的课税对象。
三、劳务报酬所得
劳务报酬所得，是指个人从事设计、装潢、安装、制图、化验、测试、医疗、法律、会计、咨询、讲学、新闻、广播、翻译、审稿、书画、雕刻、影视、录音、录像、演出、表演、广告、展览、技术服务、介绍服务、经济服务、代办服务以及其他劳务取得的所得。
参考资料来源：百度百科-个人所得税
本回答被网友采纳10月份工资3500+补发1000元=4500元
应交个人所得税
=（工资收入-1600-“三险一金”）*税率-速算扣除数
=（4500-1600）*15%-125=310元。
注：暂不考虑“三险一金”的计算。
