南航经营包括波音777、747、757、737,空客A330、321、320、319、300、388在内的客货运输机400架。
南航的主运营基地是广州白云国际机场、北京首都国际机场、郑州新郑国际机场。
其他基地有重庆江北国际机场、深圳宝安国际机场、厦门高崎国际机场、粤西国际机场、沈阳桃仙国际机场、乌鲁木齐地窝堡国际机场、武汉天河国际机场、半岛国际机场、长沙黄花国际机场、大连周水子国际机场、哈尔滨太平国际机场、贵阳龙洞堡国际机场、福州长乐国际机场、青岛流亭国际机场、南宁吴圩国际机场、桂林两江国际机场。
在亚洲地区主要与大韩航空公司及美国西北航空公司进行全面的共享代码的协议。